枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis），是芽孢杆菌属的一种，CAS号68038-70-0。单个细胞0.7～0.8×2～3微米，着色均匀。无荚膜，周生鞭毛，能运动。革兰氏阳性菌，可形成内生抗逆芽孢，芽孢0.6～0.9×1.0～1.5微米，椭圆到柱状，位于菌体中央或稍偏，芽孢形成后菌体不膨大。生长、繁殖速度较快，菌落表面粗糙不透明，污白色或微黄色，在液体培养基中生长时，常形成皱醭，是一种需氧菌。这一菌种主要有以下作用：抑菌杀菌的作用：因为它适应能力强，繁殖速度快，所以它能很快的占据土壤的空间和食物，这样就抑制了有害菌的繁殖；枯草芽孢杆菌能分泌抗生素和酶类物质，从而起到杀害病原菌的作用。促生、减少病虫害的作用：枯草芽孢杆菌能够诱发植物自身抗病机制从而增强植物的抗病能力，减少病虫害的发生；也能够分泌一些类似植物生长激素调节剂的化学物质，促进根系发育，促进作物的生长。培肥地力，调理土壤：枯草芽孢杆菌可以大量的分解土壤有机质，使有机质变为能够被作物直接吸收利用腐殖质；改善土壤的团粒结构，打破板结，增加疏松性，有效遏制土壤退化，改良盐碱地；改善土壤中的微生物结构，减少病原菌的而产生，改善生态环境。
氨基酸包衣膜是微生物肥料颗粒结构中的外层，起到保护和稳定作用。氨基酸是作物生长和发展所需的一种营养物质，它可以作为生物菌株生长的基质，帮助微生物菌株繁殖和生长，从而更好地发挥微生物肥料的作用。在颗粒制备过程中，氨基酸包衣膜可以有效地保护微生物菌株免受外界环境的干扰和损坏。同时，氨基酸包衣膜在土壤中缓慢溶解，从而释放有机氮和微量元素等营养物质，为作物提供长效的肥料。
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